首屆全球數智教育創新大賽 | 創新賽道生命科學組

7833e494e9374057a63af699ea099d93.jpg

一、賽事背景

賽題名稱:天然產物的靶點活性預測

本賽題旨在通過整合數智技術和生物技術,推動天然產物藥物發現👲🏿。參賽者將使用人工智能和計算生物學來預測天然藥物分子與免疫細胞靶點的結合親和力和選擇性,開發評估這些相互作用的工作流程或算法🩶。禮達先導將提供實驗支持,利用基於探針的自動化藥物靶點蛋白質組學平臺驗證預測結果。

二、賽題內容

大賽支持單位禮達先導將為生命科學賽道的參賽團隊提供免費的實驗支持🍑,利用基於靶點探針的自動化藥物靶點蛋白組學平臺👩‍⚕️𓀒,結合“濕”實驗技術,評估“幹”實驗技術預測的分子在活細胞層面與免疫細胞靶點組的結合數據。

60d0f064d6754ac5a9fdc6dba18c43a9.jpg

實驗支持

靶點識別過程涉及多個實驗步驟和數據分析☄️:

藥物孵育:天然藥物分子與免疫細胞共同孵育。藥物被細胞攝取並特異性地富集於其相互作用的靶點附近⟹。高親和力的藥物與靶點蛋白形成穩定的相互作用。

標記與富集:藥物與靶點相互作用後🏯,使用多靶點探針對靶點蛋白進行共價標記。通過檢測多個蛋白標記的強度變化,可以識別該配體的靶點蛋白組👨‍👩‍👧‍👦。

樣品處理:孵育後的細胞經過裂解、蛋白沉澱👵🏻、酶解、標記和富集等步驟👨‍👧‍👦,得到帶探針修飾的肽段樣品。

質譜分析:使用串聯質譜儀 (如Orbitrap Fusion Lumos/Orbitrap Fusion Eclipse)對樣品進行檢測,應用TMT-SPS-MS3等方法獲取帶探針修飾肽段的定量結果👩‍🍳。

數據處理:通過數據處理,識別出DMSO組與藥物組比例顯著變化的蛋白,這些蛋白即為藥物的結合靶點蛋白。

c016f8fcea1744bd84fcad7e688a1613.jpg

實驗流程示例

d03b33a1140f48d4a0aa7b3727d9121c.jpg

實驗結果示例

三、參賽資格

1. 參賽人員須為高校全日製在校本科生、碩士生或博士生🛋🍙,在校生身份以大賽通知正式發布之日為準。

2. 每個參賽項目團隊人數不得超過10人,其中來自同一所高校的人數不得超過5人。每人只能參加1個創新賽道參賽項目團隊。

3. 每個參賽項目可聘請1-2名指導老師🧘🏿📵,指導老師須為聯盟成員單位正式在職教師。如參賽隊伍成員均來自非聯盟成員單位💲👰🏻‍♂️,須自行聯絡並聘請聯盟成員單位的指導老師🏋🏼‍♀️。

4. 報名完成後🤶🏻,參賽團隊負責人🍡、成員及指導老師均不得變更🏋🏻‍♂️。

5. 比賽過程中🌳🛄,一旦發現提交的材料存在虛假、抄襲或者侵犯他人知識產權,將被取消參賽資格🧑🏻‍🦼。

6. 大賽主辦和技術支持單位中涉及題目編寫、數據接觸的人員及其近親屬禁止參賽👨🏻‍🍳🧑🏼‍🍳。

四👭、賽程安排

1. 報名

報名開始🛅:2024年6月27日

報名結束🎅🏽🤲🏼:2024年8月31日

2. 初賽

初賽提交開始:2024年7月31日

初賽提交結束📆:2024年9月10日

3. 復賽

復賽提交開始:2024年9月15日                

復賽提交結束:2024年10月15日

4. 決賽

2024年10月下旬,具體時間另行通知

5. 頒獎

2024年11月初進行頒獎

頒獎儀式將在中國北京舉辦🤏🏿,具體時間和形式另行通知

賽程安排所提到的時間均為北京時間👋🏽。大賽組委會保留必要時更新比賽賽製及時間表的權利🏇🏿。

五、評選標準

1. 提交規則

比賽期間不限提交次數,賽事組僅以提交截止日期前的最後一次提交打分👩🏽‍🦳。

2. 初賽

任務說明:參賽團隊需在提供的靶點數據集範圍內,對70個指定的天然產物分子的靶點親和力進行預測。針對每個天然產物分子,推薦20個最可能有結合能力的靶點。

評審標準👂🏼:每個天然產物分子的推薦靶點中,至少有一個靶點是實驗驗證中證實有結合能力的靶點,則該分子得1分🍄‍🟫,最高分為70分。初賽得分前30名的隊伍將進入復賽😦👨‍🔬。

3.復賽

任務說明:參賽團隊需在提供的靶點數據集範圍內🍮,對100個指定的天然產物分子的靶點親和力進行預測。針對每個天然產物分子,推薦20個最可能有結合能力的靶點。

評審標準🐍:每個天然產物分子的推薦靶點中👨🏻‍🦼‍➡️,每有一個靶點是實驗驗證中證實有結合能力的靶點得1分🤵🏿‍♂️,每個分子不超過5分,最高分為500分🤛🏽🤽‍♂️。復賽得分前10名的隊伍將晉級決賽答辯。

4.決賽

任務說明◾️:決賽將視情況以線下或線上答辯的形式進行;

評審標準:決賽成績將按照復賽成績70%、答辯表現30%評定,答辯評審規則請關註後續官網更新與通知𓀅。決賽答辯後,本次比賽的各個獲獎團隊將得到組委會及協作單位的正式表彰。

六👨‍🦲、獎項設置

本賽道獎金如下(金額為稅前金額,以人民幣計):

金獎1個🏜,獎金10萬元/個;

銀獎1—3個👷🏽‍♀️,獎金3萬元/個;

銅獎3—5個😖,獎金1萬元/個🧤;

優勝獎6—10個,獎金2000元/個

七、知識產權

1. 本大賽提供的賽題數據僅限用於比賽本身👉🏼,不得在比賽範圍外使用或對外傳播🚤。

2. 比賽過程中產生數據(包含濕實驗數據)歸主辦方所有🫂。

3. 比賽過程中,選手所使用的算法👨🏻‍🍼👨🏼‍🎤、工作流程等的知識產權都歸屬開發者所有𓀙🎗。

報名註冊即代表認同主辦方以上聲明🫛。

八、提交方式

請將所有提交文件壓縮為一個“.zip”文件🥵,並命名為“submission.zip”。選手無需在壓縮文件命名中添加隊伍名、提交版本、提交時間等信息,平臺會自行識別。壓縮包內應包含:預測結果:每個隊伍需提交一個Excel表格,每行為一個天然產物分子👴🏿,及預測具有活性的靶點名稱。平臺將自動校驗 Excel 的格式👨‍👦‍👦,如不符合格式要求則提交失敗🈺,選手可重新提交。

d2515195cd3e49c69d9afc74f60528ce.jpg

Excel格式

方法報告:除預測結果外,每輪提交選手需要額外提交一份pdf 報告♓️,介紹和總結預測所使用的工作流程和方法🏃🏻‍♀️‍➡️。報告不做格式要求,但不包含方法報告的提交為無效提交。

九🚣‍♂️、報名咨詢

報名網站:https://diidea.pku.edu.cn/competition/

報名咨詢:孔寅飛 01062752509

綜合事務:diidea@163.com

創新賽道生命科學組:diidea_lifesci@163.com

轉載本網文章請註明出處

意昂3体育专业提供:意昂3体育意昂3体育平台意昂3体育官网等服务,提供最新官网平台、地址、注册、登陆、登录、入口、全站、网站、网页、网址、娱乐、手机版、app、下载、欧洲杯、欧冠、nba、世界杯、英超等,界面美观优质完美,安全稳定,服务一流,意昂3体育欢迎您。 意昂3体育官網xml地圖