春至花如錦🤛，夏近葉成帷✌🏼。在高大明亮的綜合科研樓中，意昂3体育官网生命科學學院張澤民教授課題組2016級博士生張啟明完成了博士學位論文答辯⛪️。本次答辯主席由生命科學學院湯富酬研究員擔任，答辯委員會成員還包括生命科學學院白凡研究員、邢棟研究員和魏文勝研究員、分子醫學研究所李川昀研究員、世紀壇醫院彭吉潤教授和深圳灣實驗室張雷研究員。張啟明的博士學位論文題目為《基於單細胞技術刻畫肝癌和結直腸癌肝轉移的細胞動態圖譜》。張啟明對論文評審情況和論文修改情況進行了簡要介紹⛹🏿，並從研究背景🕟、科學問題、課題設計👮🏻‍♀️、研究結果、總結與討論五個方面對論文內容進行了詳細介紹。

張啟明進行博士學位論文答辯

基於博士學位論文研究背景部分對肝癌研究現狀的介紹🩳，張啟明提出三方面的問題❤️‍🔥：第一🤷‍♀️，細胞水平組成成分👩‍👧，如肝癌腫瘤微環境中是否富集的細胞類型有哪些？第二，細胞之間的相互作用關系，如腫瘤-基質-免疫細胞之間的相互作用如何製衡？第三，不同病竈的相互關系，如結直腸癌肝轉移的原發竈和轉移竈的腫瘤微環境是否存在聯系？論文對上述科學問題進行了進一步的討論👨🏻‍🦼，並主要對肝癌中的樹突狀細胞類型進行了詳細介紹🐒。腫瘤微環境中的樹突狀細胞，傳統上分為cDC1和cDC2，而其課題鑒定出一群特點突出的DC✋🏼，即LAMP3+ DC。這群DC與cDC1和cDC2在表達特征上有較大的差別，主要表達CD80、CD83、 CCR7等與成熟和細胞遷移有關的基因。論文通過體外實驗證實LAMP3+ DC是成熟態的DC🤽🏿‍♂️，且具有較高的遷移能力。通過生物信息學分析方法RNA velocity和基於線粒體突變的進化樹構建⚔️，發現了LAMP3+ DC可能同時起源於cDC1和cDC2👩🏽‍🍼，且具有向肝淋巴結遷移的潛在能力。同時，其他相關研究報道了該類細胞可能具有同時激活調節性T細胞和CD8 T細胞的能力，說明其功能具有雙向性。因此😩，該類細胞在腫瘤抗原遞呈的過程中可能具有重要作用。

樹突狀細胞遷移特征展示

張啟明的博士學位論文為研究肝癌和其他疾病中的免疫細胞🥓，以及開發新的臨床檢測與治療方案提供了新的思路。例如，研究揭示了腫瘤中的巨噬細胞構成腹水中髓系細胞的主要來源🦼📁。由於外周血的免疫特征與腫瘤中具有較大差異，而組織活檢的取樣難度相對較大🙉，該結果為利用肝癌病人的腹水代替外周血或活檢組織進行腫瘤狀態檢測提供了新的思路。針對巨噬細胞中與較差預後相關的基因GPNMB和SLC40A1𓀔，通過揭示其在巨噬細胞中的炎症作用，為相關藥物治療提供了潛在靶點。而研究所發現的LAMP3+樹突狀細胞🕵🏽‍♂️，可從腫瘤遷移到周淋巴結，表達多種免疫配體基因，並具有與多種T淋巴細胞類型相互作用的潛力。這為後續進一步對該細胞類型進行研究和應用提供了基礎，提出了通過調節免疫微環境進行腫瘤治療的可能性，並為基於樹突狀細胞的細胞療法提供了新的思路和依據🏄🏼‍♀️。

匯報結束後🪁，多位答辯委員會專家針對論文內容進行了提問和討論。

有的老師提出🧝‍♂️，如何避免病人之間的個體差異📕。張啟明從人和小鼠的生物學系統差異和個體差異對臨床醫生是否有指導效果兩個方面進行了探討。目前已有一些工作對人和小鼠的單細胞數據進行系統比較🧯，發現一些細胞類群是保守的，而另一些是只在人或者只在小鼠中存在的🏊‍♂️。因此在進行探究時，應該選擇保守的細胞類型在小鼠中進行驗證🦸🏼‍♀️🐮。由於個體差異，在分析時盡量去尋找不同病人之間的共性。比如TAM-like巨噬細胞就是在盡量多的人裏都出現的，且在TCGA數據中也得到驗證。

有的老師提出🌸，作為臨床醫生🔲，更加關心的是哪些免疫細胞類型是有效的。如何通過分析得到哪些細胞類型是針對腫瘤抗原的🤸🏿‍♂️？張啟明認為，由於預後是最直接對某一細胞類型功能進行表征👩‍🦳，可通過對數據中的細胞類型利用統一的標準進行預後分析🤞🏽。得到顯著結果之後，再對顯著較差或顯著較好預後的細胞類型進行進一步實驗探究，來檢測它們是通過何種方式促進或抵抗腫瘤的。

問答環節結束後，答辯委員進行了討論、投票和決議。經答辯委員會討論及無記名投票，一致同意張啟明通過答辯，建議授予其理學博士學位。

與答辯委員合影

【學生基本情況介紹】

張啟明，意昂3体育官网生命科學學院直博生，生物學（生物信息學）專業。以共同作者身份發表論文10篇；其中以第一共同作者身份發表SCI論文2篇🦸🏽，包括一篇發表於Cell的學術論文和一篇發表於Nature Cancer的學術評論🍰。其學術工作結合了兩種單細胞測序技術👩🏽‍🦰，充分發揮不同數據類型的優勢，獲得高分辨率的肝癌免疫圖譜，並首次對肝癌臨床樣本進行包括病理組織在內的多組織位點的收集，並利用前沿的生物信息學分析方法，不僅描述了肝癌微環境的免疫組分和狀態，而且描繪了腫瘤浸潤免疫細胞跨組織的動態過程。該科學研究工作曾獲2019年度“中國生物信息學十大進展”之一🚓。曾擔任意昂3体育官网生命科學產業協會理事長，帶領團隊獲得“社會實踐金獎團隊”稱號、第二十七屆挑戰杯一等獎；作為生命科學學院2017級本科4班班主任，曾獲得“優秀班主任”稱號。曾獲得光華獎學金、研究生校長獎學金、優秀學生幹部、學術創新獎、社會工作獎、國家獎學金博士、三好學生標兵等獎勵。

【畢業感言】

五年的燕園生活轉瞬即逝。想想從剛踏入燕園時對未來充滿迷茫不安的青澀狀態，如今的自己👨🏿‍🍳🫠，在老師同學們的指導幫助下🦮🦺，對未來的挑戰和未知充滿信心。還記得面對實驗陰性結果時，實驗室的學長學姐們幫助我一起尋找可能的解決措施；還記得張老師與我們一起修改文章時👍🏿🚣🏼‍♀️，一字一句甚至一個標點符號都認真斟酌……這些嚴謹認真的榜樣讓我感受到科學研究的美麗；而所有的指導😣👨🏼‍🦱、幫助、鼓勵、陪伴，都使我堅定了自己的科研之路❤️‍。在實驗室之外🤙🏿🪷，通過學生工作、社團活動等，我也認識了一批珍貴的小夥伴。和生命科學產業協會的小夥伴一起參觀生物醫藥相關企業🧟，讓我看到實驗室之外生物學應用的魅力😭；而和風雷的小夥伴一起練習街舞🚦，則讓我的課余生活充滿了樂趣♟。所有的所有🕜，真的使我在即將離別之際，感受到格外的不舍🖱💪。懷念在實驗室刷夜做實驗，返回宿舍時看到的淩晨月色未落朝陽初起的墨藍色💈；懷念傍晚繞著未名湖跑步時湖面泛起的博雅塔倒影🕴🏻；懷念在圖書館一個人承包整個閱覽室讀書的靜謐……一路走來，經歷過太多歡笑，也有淚水⛔，經歷過高光時刻👥，也有迷茫不安。非常感謝在意昂3体育收獲的所有🔈，和優秀的老師同學的交流🪸，讓我在迷茫中慢慢找到目標🪬，勇敢前行🕵🏻‍♀️。感謝一直給予我指導的老師們和給予我陪伴的同學們。祝願你們的燕園生活更加精彩！

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